Choisir le type d’\u00e9tude <\/h2>\n\n\n\n
Il existe plusieurs types de revue de litt\u00e9rature : <\/p>\n\n\n\n
- \n
- Revue narrative de la litt\u00e9rature <\/strong>(narrative review ou literature review) : vous ne cherchez pas l’exhaustivit\u00e9 ; c’est une m\u00e9thode int\u00e9grative (et non agr\u00e9gative) o\u00f9 vous organiserez les \u00e9tudes en cat\u00e9gories logiques, avant de les d\u00e9crire et les r\u00e9sumer ; <\/li>\n\n\n\n
- Revue syst\u00e9matique de la litt\u00e9rature<\/strong> (systematic review) : c’est la \u00ab\u00a0revue de litt\u00e9rature\u00a0\u00bb classique qui r\u00e9pond \u00e0 une question pr\u00e9cise, en cherchant l’exhaustivit\u00e9 dans le recueil des \u00e9tudes puis des donn\u00e9es, et en \u00e9valuant le risque de biais des \u00e9tudes (puis de la revue) ; <\/li>\n\n\n\n
- Revue parapluie<\/strong> (umbrella review) : c’est une revue syst\u00e9matique… de revues syst\u00e9matiques !<\/li>\n\n\n\n
- Revue rapide de la litt\u00e9rature <\/strong>(rapid review) : c’est une revue syst\u00e9matique… mais en omettant des m\u00e9thodes sp\u00e9cifiques, pour gagner du temps (notamment pour r\u00e9pondre rapidement, par exemple aux d\u00e9buts de pand\u00e9mie COVID-19)<\/li>\n\n\n\n
- Revue de la port\u00e9e \/ de la d\u00e9limitation de l’\u00e9tendue (scoping review)<\/strong> : c’est comme une revue syst\u00e9matique… mais la question de recherche et le ph\u00e9nom\u00e8ne ne sont ni tr\u00e8s pr\u00e9cis, ni sp\u00e9cifiques. On l’utilise dans un domaine o\u00f9 la recherche est \u00e9merge (par exemple aux d\u00e9buts des recherches sur le COVID Long).<\/li>\n\n\n\n
- M\u00e9ta-analyse<\/strong> : c’est une m\u00e9thode statistique qui permet de r\u00e9sumer les r\u00e9sultats de plusieurs \u00e9tudes en des estimations chiffr\u00e9es (car le Petit Prince avait raison).<\/li>\n\n\n\n
- etc.<\/li>\n<\/ul>\n\n\n\n
\n
Les grandes personnes aiment les chiffres. Quand vous leur parlez d’un nouvel ami, elles ne vous questionnent jamais sur l’essentiel. Elles ne vous disent jamais : quel est le son de sa voix ? Quels sont les jeux qu’il pr\u00e9f\u00e8re ? Est-ce qu’il collectionne les papillons ? Elles vous demandent : Quel \u00e2ge a-t-il ? Combien a-t-il de fr\u00e8res ? Combien p\u00e8se-t-il ? Combien gagne son p\u00e8re ? Alors seulement elles croient le conna\u00eetre. \u2014 Antoine de Saint-Exup\u00e9ry, Le Petit Prince<\/em>.<\/p>\n<\/blockquote>\n\n\n\n
En qualitatif, il existe \u00e9galement des m\u00e9thodes de synth\u00e8se visant \u00e0 cr\u00e9er un consensus : on a d\u00e9j\u00e0 parl\u00e9 bri\u00e8vement des groupes nominaux<\/strong> et de la m\u00e9thode Delphi<\/strong>… Il en existe d’autres, uniquement sur la litt\u00e9rature : <\/p>\n\n\n\n
- \n
- revue narrative qualitative <\/strong>: idem \u00e0 la revue narrative quantitative ; <\/li>\n\n\n\n
- m\u00e9ta-synth\u00e8se qualitative<\/strong> et m\u00e9ta-ethnographie <\/strong>: similaire \u00e0 une revue syst\u00e9matique, sur des \u00e9tudes qualitatives, afin de synth\u00e9tiser (et g\u00e9n\u00e9rer) de nouvelles connaissances ; <\/li>\n\n\n\n
- revues critiques, revues r\u00e9alistes :<\/strong> \u00e9valuer ou expliquer les ph\u00e9nom\u00e8nes ; <\/li>\n\n\n\n
- etc.<\/li>\n<\/ul>\n\n\n\n
Recueillir des donn\u00e9es : modalit\u00e9s de recueil et modalit\u00e9s d’\u00e9chantillonnage<\/h2>\n\n\n\n
Nous nous attarderons ici sur la revue syst\u00e9matique de litt\u00e9rature. <\/p>\n\n\n\n
Elle r\u00e9pond \u00e0 des \u00e9tapes claires, pr\u00e9cises, rigoureuses et transparentes (pour \u00eatre reproductible), notamment d\u00e9taill\u00e9es par la revue Cochrane<\/a> : <\/p>\n\n\n\n
- \n
- d\u00e9finir la question de recherche (avec le cadre PICO)<\/li>\n\n\n\n
- r\u00e9diger un protocole avec les crit\u00e8res d’inclusion et d’exclusion des \u00e9tudes <\/li>\n\n\n\n
- choix des bases de donn\u00e9es \u00e0 interroger et m\u00e9thodes d’analyses pr\u00e9vues<\/li>\n\n\n\n
- cr\u00e9ation de l’\u00e9quation de recherche <\/li>\n\n\n\n
- recherche exhaustive dans les bases de donn\u00e9es choisies<\/li>\n\n\n\n
- s\u00e9lection des \u00e9tudes en double aveugle<\/li>\n\n\n\n
- analyse des \u00e9tudes avec leurs r\u00e9sultats et leurs biais (selon la grille Cochrane par exemple) <\/li>\n\n\n\n
- synth\u00e8se des r\u00e9sultats : qualitative ou parfois quantitative (m\u00e9ta-analyse) <\/li>\n\n\n\n
- \u00e9valuation de la qualit\u00e9 des preuves (GRADE)<\/li>\n<\/ul>\n\n\n\n
Insistons ici sur l’importance de tout noter d\u00e8s le d\u00e9part : votre diagramme de flux listera les \u00e9tudes incluses, exclues, le stade et motif d’exclusion (doublons, hors sujet \u00e0 la lecture du titre car sur l’animal \/ sur une autre population etc., exclus apr\u00e8s lecture du r\u00e9sum\u00e9, exclus apr\u00e8s lecture de l’article complet). <\/p>\n\n\n\n
Quand s’arr\u00eater ? <\/h2>\n\n\n\n
Dans une revue syst\u00e9matique de litt\u00e9rature, on vise l’exhaustivit\u00e9 sur une p\u00e9riode choisie.<\/p>\n\n\n\n
Cela soul\u00e8ve surtout la question du temps (si on part de 15 000 \u00e9tudes, c’est… compliqu\u00e9 pour une th\u00e8se de m\u00e9decine). Il convient donc de pr\u00e9voir une question (et donc une \u00e9quation) de recherche r\u00e9aliste, visant un probl\u00e8me pr\u00e9cis, \u00e9ventuellement dans un sous-groupe… <\/p>\n\n\n\n
Logiciels d’analyse<\/h2>\n\n\n\n
Il existe plusieurs outils et logiciels d’analyse pour la revue syst\u00e9matique de litt\u00e9rature, tels que Covidence<\/a>… payant \u00e0 289$\/an par \u00e9tudiant. Voici des alternatives gratuites : <\/p>\n\n\n\n
- \n
- Rayyan<\/a> <\/li>\n\n\n\n
- Collandr<\/a><\/li>\n\n\n\n
- Abstrackr<\/a><\/li>\n\n\n\n
- Systematic review accelerator<\/a><\/li>\n\n\n\n
- DistillersR<\/a>\u00a0<\/li>\n<\/ul>\n\n\n\n
Il y a aussi Systematic Review Toolbox<\/a> qui permet de trouver des outils selon le type de votre revue, et le stade (protocole, s\u00e9lection, analyse…) <\/p>\n\n\n\n
Analyse des donn\u00e9es<\/h2>\n\n\n\n
Le travail va se baser en 3 temps : transcrire – d\u00e9crire (coder) – analyser<\/strong> (organiser)<\/strong><\/p>\n\n\n\n
Transcrire<\/h3>\n\n\n\n
Vous allez synth\u00e9tiser les donn\u00e9es recueillies dans des tableaux pr\u00e9vus \u00e0 cet effet (notamment ceux de la grille PRISMA – nous reparlerons dans 2 jours des grilles, sujet que j’ai pour l’instant choisi de garder de c\u00f4t\u00e9 pour essayer d’avoir des billets assez courts et didactiques).<\/p>\n\n\n\n
La s\u00e9lection des \u00e9tudes en double aveugle permet d’am\u00e9liorer la qualit\u00e9 de votre s\u00e9lection et donc de votre revue. <\/p>\n\n\n\n
D\u00e9crire <\/h3>\n\n\n\n
Vous allez reporter des \u00e9l\u00e9ments tels que : <\/p>\n\n\n\n
- \n
- le nom de l’\u00e9tude (par exemple Auteur. Revue (Ann\u00e9e) [r\u00e9f]), <\/li>\n\n\n\n
- le type d’\u00e9tude, <\/li>\n\n\n\n
- les ann\u00e9es, <\/li>\n\n\n\n
- le public, <\/li>\n\n\n\n
- le test choisi, <\/li>\n\n\n\n
- les r\u00e9sultats principaux<\/li>\n<\/ul>\n\n\n\n
Analyser<\/h3>\n\n\n\n
L’analyse peut \u00eatre textuelle et\/ou faire appel \u00e0 des techniques de m\u00e9ta-analyse : <\/p>\n\n\n\n
- \n
- identifier les th\u00e9matiques principales (sections de votre chapitre r\u00e9sultats)<\/li>\n\n\n\n
- rep\u00e9rer les convergences et divergences (qui seront discut\u00e9es : m\u00e9thodologies diff\u00e9rentes, populations diff\u00e9rentes, biais, etc.) <\/li>\n\n\n\n
- synth\u00e9tiser avec des tableaux (et \u00e9ventuellement des graphiques ou diagrammes – forest-plot pour une m\u00e9ta-analyse notamment).<\/li>\n<\/ul>\n\n\n\n
Une attention particuli\u00e8re est port\u00e9e aux biais dans les revues de litt\u00e9rature et m\u00e9ta-analyse<\/strong> : <\/p>\n\n\n\n
- \n
- biais des \u00e9tudes s\u00e9lectionn\u00e9es : sont-elles de qualit\u00e9 ? <\/li>\n\n\n\n
- biais de la litt\u00e9rature : y’a-t-il des biais de publication ? (recours \u00e0 un funnel plot)<\/li>\n\n\n\n
- biais de la revue elle-m\u00eame : biais de s\u00e9lection, etc. <\/li>\n<\/ul>\n\n\n\n
Apr\u00e8s avoir balay\u00e9 les principales m\u00e9thodes utilis\u00e9es en th\u00e8se de m\u00e9decine, nous allons parler de r\u00e9glementation, et entrer un peu plus dans le d\u00e9tail en fournissant des outils utiles pour pr\u00e9parer l’\u00e9tude… avant d’attaquer les r\u00e9sultats.<\/p>\n\n
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- Collandr<\/a><\/li>\n\n\n\n
- Rayyan<\/a> <\/li>\n\n\n\n
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- Revue syst\u00e9matique de la litt\u00e9rature<\/strong> (systematic review) : c’est la \u00ab\u00a0revue de litt\u00e9rature\u00a0\u00bb classique qui r\u00e9pond \u00e0 une question pr\u00e9cise, en cherchant l’exhaustivit\u00e9 dans le recueil des \u00e9tudes puis des donn\u00e9es, et en \u00e9valuant le risque de biais des \u00e9tudes (puis de la revue) ; <\/li>\n\n\n\n