Le blog de Michaël

Nous voici au bout de ce calendrier de l’avent… La thèse est presque finie ! Il reste quelques « détails »… d’importance !

Références bibliographiques

Votre thèse est finie… il faut maintenant jeter un oeil à ce chapitre, que vous avez créé et laisser se mettre à jour automatiquement au fur et à mesure des citations.

Vérifiez ce qui est attendu d’une thèse (en général, format Vancouver) et ce que vous avez. Il arrive que Zotero n’intègre pas bien certaines informations. En général, vos références doivent être au format « Auteurs. Titre. Journal/source. Année;Numéro(Volume):page-page. Disponible sur : »
Si vous avez un doute, essayez de retrouver vous-même la source avec les informations que vous donnez…

Si vous voyez des erreurs (vous en verrez forcément !), il ne faut pas les modifier ici ! Il faut retourner dans Zotero, améliorer la référence bibliographique en ajoutant/corrigeant les informations, et ensuite actualiser (refresh) sur votre fichier de thèse.

Ce ne sera pas les 30 (à 120…) minutes les plus passionnantes de votre vie, mais c’est ce qui permettra aussi de montrer votre sens du détail. C’est très important pour la qualité de votre thèse !

Liens d’intérêts, avertissements…

Selon les facultés, il y a parfois un avertissement à noter en début de thèse. A Lille, la page qui suit celle de titre (1ère de couverture) est :

« AVERTISSEMENT – La Faculté n’entend donner aucune approbation aux opinions émises dans les thèses : celles-ci sont propres à leurs auteurs. »

Il est également de bon ton d’intégrer une page « LIENS D’INTÉRÊTS », soit juste après celle-ci, soit après la conclusion (là aussi, selon les facultés). Un lien d’intérêt est toute relation (financière ou non) que vous avez avec une entité (industrie, association, institution…) qui pourrait influencer vos jugements, actions, décisions… C’est très vaste : financement, subvention, honoraires, collaborations scientifiques, etc. Il faut être transparent sur ces liens d’intérêt (vous pouvez bien sûr déclarer ne pas en avoir !).
Un conflit d’intérêt, c’est un lien d’intérêt problématique : les intérêts (personnels, professionnels, financiers) ne permettent pas une objectivité sur le travail.

Annexes

J’ai parlé des annexes dans les premiers billets… C’est assez libre, vous pouvez les utiliser pour :

• détailler un point d’introduction : historique (de la maladie, du traitement), répartition géographique avec des cartes, discussion physiopathologique, évolutionniste (comment expliquer que la sélection naturelle n’a pas éliminé ce trait pathologique, existe-t-il un avantage sélectif, etc.) ;
• illsutrer des éléments de matériels et méthodes : présenter le questionnaire utilisé ; présenter les documents réglementaires obtenus (conformité CNIL, avis CPP…), etc.
• ajouter des données par rapport aux résultats : la présentation de graphiques peu utiles, des analyses en sous-groupes, etc.

Il n’y a pas de nombre d’annexes maximum : séparez chaque sujet en annexe (par exemple, « Annexe 1 – Historique de… », « Annexe 2 – Epidémiologie de… », etc.)

Si vous intégrez des tableaux et figures dans les annexes, je vous conseille de les nommer « Tableau A3.1 » pour le premier de l’annexe 3 par exemple.

Les références bibliographiques utilisées en Annexe s’intégreront dans la section Références bibliographqiues.

Ecrire le résumé

Il est recommandé d’écrire le résumé à la toute fin de votre thèse. En réalité, vous pouvez bien sûr le rédiger à n’importe quel moment, quand ça vous chante, mais il est certain qu’il faudra y revenir pour un dernier passage à la toute fin de votre thèse !

Le résumé va mettre l’accent sur les principales sections de votre thèse-article et la résumer en 250-300 mots environ. Il doit pouvoir se lire seul : il ne faut donc pas y utiliser des abréviations non précisées dedans (et de manière générale, il faut limiter les abréviations, vu le caractère court !)

Le résumé est très important : ce sera souvent la seule chose qui sera lue de votre thèse, voire de votre article si vous la publiez. Les mots utilisés dedans permettront de trouver votre travail…

A écrire à la fin… et pas avant (pour une conférence ou un poster…) → jeter le vieil abstract, réécrire le papier puis l’abstract !

Le résumé de thèse est structuré avec les sections Introduction – Matériels et méthodes – Résultats – Conclusion. Ca n’est pas forcément le cas dans des revues (parfois texte libre) ou lors d’un résumé pour soumission à un congrès (qui peuvent ne pas souhaiter ce découpage, ne pas avoir de section matériels, ou remplacer Conclusion par Discussion…). Lisez bien ce qui est demandé à l’auteur, par votre faculté pour la thèse.

La section introduction peut se diviser en 3 phrases :

• une phrase introduisant au champ de votre travail, compréhensible par n’importe qui — ou, au pire, par n’importe quel scientifique gravitant autour de la médecine. On ne vous demande pas un début in medias res, montrant que vous êtes expert du sujet, mais au contraire d’être pédagogue. Ce qui se conçoit bien s’énonce clairement…
• une phrase plus précise sur votre sujet qui explique qu’un pan n’est pas connu (ces deux phrases fournissent un contexte à votre travail… on peut parfois les résumer en une seule) ;
• l’objectif principal (voire secondaire) de votre travail, éventuellement au format PICO, peut être de façon assez indifférente (selon ce qui vous plait) :
  • une question (« est-ce que le recours aux Schtroumpfs est associé à une Schtroumpfose chez les Schtroumpfs ? »),
  • une phrase centrée sur l’objectif (« notre objectif était de déterminer si le recours aux Schtroumpfs est associé à une Schtroumpfose chez les Schtroumpfs »),
  • une phrase centrée sur l’hypothèse (« nous formulons l’hypothèse que la Schtroumpfose est associée à la consommation de Schtroumpfs » / « notre hypothèse était que… »),
  • une phrase centrée sur ce qui n’est pas connu (« l’association entre recours aux Schtroumpfs et la Schtroumpfose chez les Schtroumpfs reste méconnu »).

N’hésitez pas à mettre des données chiffrées précises dans votre introduction, plutôt que des approximations (sans référence bibliographique ici — mais elles sont dans votre introduction !). Par exemple ici : « Parmi les Schtroumpfs, 38 % sont atteints de Schtroumpfose. Une voie physiopathologique de la Schtroumpfose implique les récepteurs bêta-schtroumpf, dont les agonistes sont les Schtroumpfs. Notre objectif était de déterminer si le recours aux Schtroumpfs est associé à une Schtroumpfose chez les Schtroumpfs ».

La section méthodes peut aussi se diviser en 3 phrases :

• le design de l’étude, avec ou sans présentation (« Nous avons réalisé une étude épidémiologique analytique rétrospective multicentrique… » ou « Etude épidémiologique analytique rétrospective multicentrique ») ;
• la population (échantillonnage) et le mode de recrutement : « ont été inclus tous les Schtroumpfs de 18-65 ans dans la base Schtroumpf. »
• le critère de jugement principal et/ou les variables principales : « le recours aux Schtroumpfs a été recueilli dans l’historique des remboursements ».
• de façon facultative, vous pouvez ajouter quelques éléments statistiques (gestion des données manquantes, tests utilisés, seuil de 5 %, etc.). C’est vraiment si vous avez de la place : essayez plutôt d’en garder pour les résultats !

La section résultats peut là aussi se diviser en 3 phrases (ou plus) :

• décrire brièvement la population : « nous avons inclus 45 000 Schtroumpfs, dont 60 % de Schtroumpfettes ; sur la période de 2006 à 2016, 15 000 avaient consommé des Schtroumpfs… »
• donner le résultat principal en l’explicitant : « la consommation de Schtroumpfs était associée à la Schtroumpfose (p < 0,001) : parmi les 15 000 consommateurs de Schtroumpfs, 10 000 (67 %) ont développé une Schtroumpfose ; parmi les 30 000 non-consommateurs, 3 000 (10 %) ont développé une Schtroumpfose. »
• si vous avez de la place : donnez les résultats secondaires ET dans ce cas, évoquez-les dans l’objectif (introduction) et la méthode. Si vous n’avez pas la place, ne gardez que l’objectif principal en introduction / méthodes / résultats : ne citez pas un objectif non traité en résultats, ne traitez pas en résultats la réponse à un objectif non formulé.

Vous pouvez (devez) donner 2-3 nombres clés… il ne s’agit bien sûr pas de redonner tous vos résultats, mais pas non plus de faire des approximations qui laissent le lecteur dans le flou !

Enfin, la conclusion peut se diviser en… 1 ou 2 phrases (et non pas 3 !) :

• vous pouvez faire un résumé si ça vous semble pertinent : on peut décider de ne pas mettre dans « résultats » la phrase « la consommation de Schtroumpfs était associée à la Schtroumpfose (p < 0,001) » et la conserver pour la conclusion. C’est le take-home message, LE message que vous voudriez que tout lecteur retienne à la fin de la lecture.
• et surtout il s’agit de faire une ouverture compréhensible par tous (implications, spéculations, recommandations) : informer sur la Schtroumpfose, suivre les consommateurs de Schtroumpfs, etc.

Titre

Ce qu’on vient de dire pour le résumé est encore plus vrai pour le titre : il doit être clair, explicite, contenir les mots-clés (pour le référencement), donner envie de lire le travail… Vous avez le droit de proposer quelque chose d’un peu original, tant que les mots-clés y sont et que ça n’est pas énigmatique.

Remerciements

Là encore, les remerciements sont traditionnellement écrits à la fin… mais vous faites comme vous voulez !

Il y a 2 parties à ces remerciements : ceux pour le jury, ceux pour les autres.

Pour le jury, cela peut prendre la forme suivante :

A mon (ma) Président(e) de Jury / A mes juges (ou à mes assesseurs, au choix) / A mon directeur (ma directrice) de thèse

Monsieur (Madame) le (la) Professeur(e) / Docteur(e) xxxx
Professeur des Universités / Maître de Conférences des Universités / Professeur Associé / Maître de conférence associé
Intitulé de la CNU où il (elle) est nommé(e) (Médecine générale, Cardiologie, etc.)

Praticien hospitalier / médecin généraliste
Service ou lieu d’exercice

Autres fonctions notables
Membre d’un conseil ordinal, présidence de CNU, fonctions universitaires, chevalier d’un ordre, etc.
(Il ne s’agit pas de faire le CV non plus… si vous doutez, n’hésitez pas à contacter le jury pour lui faire une proposition et lui demander de corriger).

Phrases de remerciements :

• Vous présidez ce jury de thèse et jugez ce travail, veuillez trouver ici l’expression de mes meilleurs remerciements.
• Vous m’avez accueilli dans votre service avec votre grande sympathie, je tiens à vous exprimer ma profonde gratitude pour le temps et l’attention que vous avez consacrés à cette thèse.
• Vous me faites l’honneur de faire partie de mon jury de thèse. Je vous remercie pour votre présence et vos remarques.
• C’est un privilège de vous compter parmi les membres de ce jury. Je vous remercie chaleureusement pour votre disponibilité, vos conseils précieux et votre regard critique.
• etc.

Ensuite, il y a les remerciements pour vos parents, votre famille, vos proches, vos amis, votre animal de compagnie, vos confrères, co-internes, co-externes, patients qui vous ont aidé à un moment ou un autre, la personne qui vous a aidé à avoir accès à une base, à comprendre Excel, l’auteur d’un livre qui vous a été utile (…), Alexandra Elkabyan pour Sci-Hub, etc.
C’est très libre (il faut bien sûr rester poli, ne pas faire l’apologie de crimes, tenir de propos racistes ou autres…). Vous pouvez citer de bons souvenirs de votre jeunesse ou de vos études ; vous pouvez au contraire rester très sobre. Essayez de synthétiser en une ou deux pages quand même, et rappelez vous que le jury lira ces pages 😉

Pour la première fois depuis le 20, j’ai un jour de retard… mais je vais essayer de le rattraper dans le week-end ! Et j’ai eu une bonne nouvelle pour cette suite de billets, j’en parlerai peut-être dans le dernier 🙂

Nous allons parler ici « l’art de la discussion »…

L’introduction peut être vu comme un entonnoir ou un cône : on débute par une généralité, puis on affine le sujet, on évoque ce qui n’est pas connu sur le thème, on pose une question de recherche précise. La discussion inverse ce cône : on répond à la question (résultats principaux), on appuie la conclusion (nos données, les données des autres), on défend la conclusion (anticipation des critiques avec les limites) et on conclue avec les messages généraux (« ce que veulent dire mes résultats et pourquoi tout le monde devrait s’en préoccuper »).

La discussion est une section très intéressante à écrire, celle où vous avez le plus de liberté, où vous pouvez vraiment « bien écrire ». Malgré cette liberté, la discussion est très bien codifiée comme évoqué ci-dessus, avec 4 grandes parties :

• Résultats principaux
• Comparaison à la littérature
• Forces et limites
• Perspectives

Nous allons détailler les 4 parties. La conclusion est parfois incluse dedans dans certains articles ; pour la thèse, la conclusion est un chapitre séparé… nous en parlerons donc séparément !

Résultats principaux

La dernière phrase de l’introduction est une question de recherche au format PICO (par exemple « dans la population des internes de médecine générale de Lille, est-ce qu’un atelier d’expression théâtrale était associé à une amélioration de la communication ? »).

La première phrase de la discussion répond à cette question : dans notre étude, le score de communication SEGUE était significativement plus élevé dans le groupe de 52 internes ayant suivi un atelier de 2 jours d’expression théâtrale par rapport au groupe de 48 internes qui n’y a pas participé (20 vs 10 points, p < 0,05). Il ne doit pas y avoir de données inédites dans cette section : vous répétez le(s) résultat(s) principal(aux) de votre étude… et vous les discutez ensuite !

Vous pouvez donc expliquer ce que ça signifie, évoquer ce qui est nouveau / appris grâce à votre travail. Vous pouvez proposer des explications physiopathologiques éventuellement, des mécanismes pour insérer votre travail dans quelque chose de plus général (vous inversez l’entonnoir de l’introduction !)

Vous pouvez ensuite développer quelques autres résultats (objectifs secondaires notamment) et quelques données qui seront utiles dans la suite de votre discussion — pour la comparaison à la littérature notamment. La discussion peut vous permettre de proposer des hypothèses ; dans tous les cas, il faut se garder de conclure de façon péremptoire et savoir rester humble quant à la portée de votre étude (sans en minimiser l’intérêt !)

Comparaison à la littérature

Dans cette section, il faut comparer votre résultat principal à la littérature ; comme pour l’introduction, vous pouvez comparer localement, nationalement puis internationalement (encore une fois sur le schéma inverse). Si votre travail est vraiment inédit, vous pouvez comparer à quelque chose de proche. A défaut, vous pouvez juste dire que vous n’avez pas trouvé de résultat similaire dans la littérature (par exemple, si vous avez étudié l’intérêt des internes de médecine générale pour les travaux de BTP).
L’idée est de voir comment vous vous insérez dans le paysage scientifique actuel… (il est peu probable que votre travail le révolutionne, mais il s’agit de vous positionner et rappeler l’intérêt de votre étude).

Ensuite, vous pouvez comparer votre ou vos résultats secondaires (ceux qui répondent à l’objectif secondaire, qui ont fait l’objet d’une section « résultats secondaires » en résultats…).

Comme toujours, il faut privilégier les études de la littérature scientifique (plutôt que des thèses ou mémoires non publiés) : études internationales dans des revues à fort impact factor (Nature, NEJM, BMJ, JAMA, Lancet…), études internationales ou nationales dans des revues connues (Thérapie, Exercer, Presse Médicale…), puis si besoin, dans des rapports (HAS, Insee, etc.) puis des thèses.

Enfin, vous pouvez comparer les caractéristiques de votre population : cela permettra d’enchaîner avec les forces et limites, si vous avez un échantillon comparable à la population cible… ou pas !
Si vous étudiez les médecins ou l’organisation des soins, vous pouvez cette fois être amenés à utiliser des données moins issues de la littérature scientifique, telles que :

• Atlas démographique de l’Ordre National des Médecins (https://www.conseil-national.medecin.fr/sites/default/files/external-package/analyse_etude/nn4fmo/cnom_atlas_demographie_2024_-_tome_1.pdf)
• Carte des professionnels de santé libéraux de la DREES (https://drees.shinyapps.io/demographie-ps/)
• Carto APL de la DREES (https://drees.shinyapps.io/carto-apl/)
• Data de l’Assurance Maladie (https://data.ameli.fr/pages/data-professionnels-sante-liberaux/)
• Insee (https://www.insee.fr/fr/statistiques/4493549)
• Cour des Comptes (https://www.ccomptes.fr/sites/default/files/2024-05/20240513-Organisation_territoriale-soins-premier-recours.pdf)
• etc.

Forces et limites

Dans cette section, vous allez expliquer (d’abord) pourquoi vos résultats sont robustes (forces)… et anticiper les questions/critiques. Il ne s’agit pas de faire des généralités ici mais d’être précis et spécifiques avec les limitations de l’étude.

Voici tout de même quelques exemples « génériques » de forces, qui seront à adapter et personnaliser à votre étude :

• Grande taille de l’échantillon : une population d’étude importante renforce la puissance statistique et la généralisation des résultats ; cette grande taille peut être relative : si vous étudiez les patients avec une prothèse de hanche qui ont terminé l’ultra-trail du Mont-Blanc, avoir 18 patients c’est bien !
• Validité interne : c’est le moment où vous expliquez que vous avez conçu et mis une oeuvre une étude qui limite autant que possible les biais, par exemple :
  • Représentativité de l’échantillon (et extrapolabilité) : la population est comparable à la littérature, notamment avec un mode de recrutement aléatoire ;
  • Conception robuste de l’étude : une étude randomisée contrôlée, un suivi longitudinal sur plusieurs années, etc. C’est le moment de vanter les choix méthodologiques !
  • Utilisation d’outils validés : si vous avez utilisé des questionnaires, tests ou mesures standardisés, validés dans la littérature, notamment dans la langue choisie… c’est mieux, et c’est pertinent de le rappeler ici ;
• Validité externe : vous venez de comparer votre échantillon et vos résultats à la littérature : si ce que vous avez fait est cohérent avec les données existantes, cela « valide » de façon « externe » votre étude ;
• Originalité, pertinence clinique, applicabilité pratique : si vous avez fait une recherche-action, si vos résultats ont un impact rapide et direct sur la santé de la population (ou des internes ou autre), c’est le moment aussi d’en parler !

Une façon amusante de faire est de se demander comment vous auriez pu faire une étude « naze » et ce qui différencie votre travail de ça.

De la même façon, les limites doivent être personnalisées, et peuvent tourner autour des biais en quantitatif (on n’en parle pas en qualitatif !) :

• Biais de sélection (dont données manquantes, perdus de vus…) : l’échantillon peut ne pas être représentatif de la population cible, limitant la généralisation des résultats ;
• Biais d’information (mémorisation, désirabilité sociale…) : erreurs potentielles dans la collecte des données, comme des réponses biaisées, erronées, des mesures inexactes, etc. ;
• Biais de confusion : certains facteurs confondants peuvent ne pas avoir été pris en compte.
• Limitations liées au choix d’étude : une étude observationnelle ne peut pas établir de relation causale (on trouve une association entre 2 variables, pas de lien de causalité) ; un suivi court ne permet pas d’identifier des effets à long terme ; une étude chez les médecins généralistes installés ne permet pas de connaître l’avis des remplaçants, etc.

Les limites sont l’occasion de rappeler ce que vous avez mis en oeuvre pour les diminuer. Je vous rappelle ici qu’il est pertinent d’avoir déjà écrit ces limites avant même d’avoir débuté votre étude (lancé les questionnaires, réalisé des entretiens, etc.) Vous avez donc pu adapter la section méthodes pour limiter ces biais : par exemple, vous avez choisi les répondants de façon aléatoire pour limiter le biais de sélection ; vous avez choisi un délai court pour limiter le biais de mémorisation ; les réponses étaient anonymes pour limiter le biais de désirabilité sociale, etc.

Notez que la place des limites est ici : après les résultats principaux, la comparaison à la littérature et les forces… Ne commencez pas votre discussion par les limites !

Perspectives

Vous poursuivez votre « histoire » (que vous racontez) avec les perspectives :

• l’intérêt d’études de confirmation pour vos résultats principaux et/ou secondaires,
• les questions sans réponse au terme de votre travail (voire les questions nouvelles que vous avez soulevées),
• les directions futures qui n’ont pas été traitées ici car hors de votre champ, etc.

Pensez aux futurs thésards qui seront aux premiers chapitres de leurs thèses, sans sujet, et qui liront (comme vous l’avez peut-être fait) des sections « perspectives » de thèses précédentes sur un vague thème d’intérêt !

Dans toute la discussion, vous écrivez autant que possible à la voix active, au passé (pour les détails, résultats, analyses, le contexte, etc.) ; vous utilisez logiquement le présent pour ce qui est toujours d’actualité :

• « Dans notre étude, l’allaitement maternel prolongé était associé à… »
• « Darwin C. a montré que… »
• « Les résultats suggèrent que… »
• « Notre étude comporte des forces et des limites… »

… mais dans les perspectives, c’est la section de la thèse où il peut être pertinent d’utiliser le futur :

• « Dans un prochain travail, il sera pertinent d’analyser… »

Conclusion

La conclusion est un chapitre à part dans la thèse. Il est difficile de ne pas y re-répéter ce qui a été dit en résultats puis dans discussion > résultats principaux… mais ce n’est pas grave !

L’idée ici est de faire une ouverte. « So what ? » Quelles sont les implications, spéculations, recommandations de votre travail ? A quel(s) point(s) les lecteurs doivent-ils se préoccuper suite à votre thèse ? C’est le moment du « take-home message » : il doit être clair, cohérent avec l’étude. Il faut mieux un message très focalisé mais réel, plutôt qu’un message flou (« peut-être que… »), ne correspondant pas à votre travail.

Encore une fois, il faut se garder de trop extrapoler vos résultats : arrêtez vous modestement à ce que vous avez prouvé… n’allez pas sur le terrain de ce que vous souhaiteriez avoir prouvé ! Un des grands messages que je distille depuis le début est d’écrire la thèse en un premier jet, sans se soucier des résultats initialement, pour avoir un grand cadre : il ne s’agit bien sûr pas de garder une conclusion pré-écrite ! Le but est d’avoir une idée des conclusions possibles (en quantitatif, soit l’hypothèse est rejetée, soit elle ne l’est pas : vous avez 2 conclusions possibles), et de tout mettre en oeuvre pour pouvoir l’annoncer, parce que vous aurez limité les biais, etc. Pré-écrire, c’est anticiper les critiques et donc les prévenir.
Par exemple, si vous étudiez la pratique du waterpong sur la qualité du sommeil, et que sur 100 inclus, 5 avaient poursuivi l’activité à 6 mois et disaient vachement mieux dormir : non, vous n’avez pas montré que le waterpong améliorait la qualité de sommeil. Votre étude soulève la question de l’arrêt précoce plus qu’autre chose.

Si vous lisez rapidement un article, vous allez lire le titre, le résumé… et les tableaux et figures (ensuite éventuellement la dernière phrase d’introduction pour avoir l’objectif clairement en tête, puis la première phrase de discussion pour avoir les résultats principaux).

Les figures et tableaux doivent suffire pour « raconter l’histoire » toute entière, sans avoir à se référer au texte… et pourtant, il faut en utiliser le moins possible, et n’utiliser que ceux qui sont nécessaires !

Nous allons parler dans ce billet de la section résultats — que vous n’hésiterez pas à scinder en sous-section (caractéristiques ; résultats principaux ; résultats secondaires par exemple).

Quel niveau de précision faut-il avoir dans les chiffres ?

Il faut se détendre avec les décimales. Clairement, si vous avez étudié 103 personnes, et que 80 ont répondu non à une question, quelle information vous semble suffisante de précision :

• environ 80 %
• 78 %
• 77,7 %
• 77,67 %
• 77,670 %
• 77,6699 %

Le premier est correct parce que c’est ça l’information à retenir… mais il y aurait beaucoup de « environ » dans la thèse, et l’arrondi à 5 % peut être discutable ! A choisir, il faut mieux utiliser le premier (0 décimale) ou le deuxième (1 décimale). Au-delà, le gain de précision est inutile et surcharge la lecture.

Dans mes résultats, est-ce que je dois décrire la variable dans le texte, un tableau ET un graphique quand c’est important ?

Non ! Vous ne devez pas avoir de redondance dans vos résultats (le minimum possible en tout cas). Il ne faut surtout pas faire un tableau récapitulatif PUIS une description de chaque variable où vous mettez les valeurs absolues, relatives et un graphique…

Le message est simple : peu de figures, mais que des figures pertinentes et utiles !

Les résultats doivent tenir sur 2-3 pages, et le principal est synthétisé dans votre tableau 1 pour une étude descriptive (caractéristiques de la population)… avec éventuellement un tableau 2-3 pour les études analytiques.

J’ai fait mon questionnaire sur un questionnaire qui fournit des graphiques : puis-je les utiliser dans mes résultats ?

Oui, toutefois méfiez-vous d’avoir ce que vous voulez : est-ce que vous avez la dispersion (écart-type), est-ce que vous voulez des histogrammes pour des échelles de Likert (ou peut-être des boîtes à moustaches), etc. Si vous refaites d’autres graphiques ensuite, aurez-vous le même design tout au long de votre thèse ou est-ce qu’il y en aura depuis un questionnaire en ligne, d’autres sur Excel, d’autres sur R ? Gardez une homogénéité dans la thèse.

Et dans tous les cas, préférez un tableau 1 qui résume toutes les informations que vous cherchiez au moment de la rédaction de votre objectif et de votre méthode en quelques lignes. Ca sera le billet de demain ça !

Comment choisir entre figure et tableau ?

La figure va permettre un impact visuel pour un résultat particulier ; elle va montrer des tendances (« trends and patterns »), raconter une histoire courte…

Le tableau va permettre de donner des valeurs précises pour beaucoup de variables.

Si vous hésitez entre les deux : le tableau est une valeur sûre !

A propos des tableaux…

Le titre d’un tableau identifie le point spécifique : il faut utiliser les mêmes mots clés dans le titre, les colonnes et le texte… et être aussi bref que possible sans perdre en précision ! Par convention, le titre est au-dessus du tableau (et en-dessous de la figure).

Le format du tableau est simple : la plupart du temps, il y a 3 lignes horizontales (au-dessus et en-dessous de la première ligne, et une tout en bas sous les données). C’est un modèle classique, à privilégier dans la thèse. En général, il ne faut pas laisser des lignes partout (ça ne fait pas professionnel, ça surcharge le tableau…) ; dans un tableau un peu complexe, vous pouvez toutefois en mettre entre certaines parties si ça aide à la lecture. Et bien sûr, dans le cadre d’une publication, vérifiez bien sûr ce qui est demandé par l’éditeur ! Enfin, comme présenté dans le billet précédent, il faut bien tout aligner, utiliser une information par case…

Les colonnes ne doivent pas être multipliées, il faut se focaliser sur le point principal : caractéristiques – groupe 1 – groupe 2. Vous pouvez même, si vous faites des comparaisons, ne pas faire une colonne p-value et la remplacer par une astérisque explicitée en légende (ex : * p < 0,05, T-test ou test exact de Fisher, selon la situation)

Dans les lignes, vous pouvez rappeler : l’unité et le nombre de données recueillies (pour identifier les données manquantes). Par exemple : poids (kg) (N = 82) ; taille (cm) (N = 81). Evidemment, si vous avez recueilli le même nombre de données pour toutes les variables, il ne faut pas le mettre à chaque ligne : gardez à l’esprit qu’il faut épurer tout ce que vous pouvez…

La légende (footnote) d’une tableau utilise des symboles superscripts (variable selon le journal visé : *, ¶, etc.) ; c’est l’endroit où vous pourrez expliquer la signification statistique (p-value…), des détails de définitions et abréviations, etc. Notez que si vous utilisez un terme déjà abrégé dans le texte… il faut le réexpliciter dans le tableau, qui doit pouvoir se lire indépendamment !

Enfin, un tableau ne doit pas déborder dans les marges… Le plus simple est de sélectionner tout le tableau et faire un Ajustement automatique à la fenêtre puis un Ajustement automatique au contenu.

A propos des figures

Il existe 3 types de figures :

• la preuve primaire (radiographie, photographie, planche d’anatomopathologie, etc.) : voir, c’est croire !
• le graphique :
  • linéaire (Y en fonction de X : montre la tendance au fil du temps, de la posologie, de l’âge…) ;
  • bargraphe (comparer les groupes à un temps t : mettre les n au sommet, préciser les groupes sous l’abscisse) ; il existe aussi avec des valeurs individuelles
  • nuage de points (montrer une corrélation linéaire – ou autre relation – entre deux variables, à travers des points individuels… attention à ne pas tracer une droite entre 3 points par contre, pour « montrer » une relation linéaire abusive) ;
  • histogrammes
  • boîtes à moustaches (très bien pour illustrer une médiane, l’intervalle interquartile…)
  • courbes de survie
  • etc.
• le diagramme :
  • diagramme de flux (flowchart) : pour réaliser votre flowchart, vous pouvez utiliser le site https://app.diagrams.net ou en retrouver ici sur le site Objectif Thèse : https://docs.google.com/presentation/d/1Ybuf064q4-_OPvc_gAp6qNQaoLgRzjE6/edit#slide=id.p1
  • diagramme de causes-effets / cycles
  • modèle (notamment en qualitatif > théorisation ancrée)

Le titre est en-dessous de la figure (et au-dessus du tableau, pour rappel !)

La légende comporte donc un titre bref (attention à ne pas le mettre AUSSI sur la figure…), les détails expérimentaux principaux, les définitions des symboles, l’explication des groupes (A, B, C, D…), les informations statistiques (tests, p-value…), les abréviations… Comme pour les tableaux, la figure doit pouvoir se lire seule !

Les graphiques doivent raconter une histoire visuelle rapide : rester simple… sinon il faut peut-être utiliser un tableau !

Quelques règles d’écriture…

Utilisez la voix active ici et réfléchissaient aux verbes utilisés pour éviter les seuls « être » et « avoir ».

Pour le choix du temps, comme d’habitude :

• ça sera au passé pour vos résultats (« les femmes étaient plus âgées que les hommes »…)
• … sauf pour ce qui est toujours vrai (« la figure 1 montre que » et non pas « a montré que »)

On ne répète pas dans un texte ce qu’il y a dans un tableau et une figure ; le texte l’introduit ou le substitue. Par exemple « les films d’action comportaient en moyenne plus de combats que les comédies romantiques (Tableau 1) ». Il n’est pas utile de dire :

• « Le tableau 1 résume les caractéristiques » / « les caractéristiques sont résumées dans le tableau 1 » : gardez votre encre ;
• « Les films d’action comportaient 22 minutes (écart-type : 6 minutes) de combat contre seulement 3 minutes (écart-type : 2 minutes) pour les comédies romantiques (p < 0,05) (Tableau 1). » : ces données sont déjà présentes dans le tableau.

Le texte de la section résultats doit résumer ce que les données montrent : il va pointer des relations simples, décrire les grandes tendances et citer/annoncer les figures et tableaux. Il apporte des informations complémentaires (par exemple une différence entre 2 pourcentages présentés dans un tableau), ou insiste sur queqlues nombres parmi les plus importants de votre travail.

N’oubliez pas de parler des résultats négatifs !

Si une différence est « significative », votre lecteur comprendra « statistiquement significatif au seuil retenu (5 % en général) ». Ne l’utilisez jamais dans le sens « ohlala, c’est pas mal quand même, hein »… De manière générale, évitez toute « discussion » dans vos résultats, qui doivent être dépourvus d’émotions. Le « seulement 3 minutes » proposé ci-dessus pour les combats dans les comédies romantiques aurait pu vous faire tiquer : ce seulement est un jugement de valeur et une interprétation qui n’a pas sa place dans les résultats.

Comme vous ne mettrez pas de discussion dans les résultats, gardez-vous d’y (re)mettre de la méthode : vous ne discutez pas comment ou pourquoi vous avez fait ça, mais ce que vous avez trouvé !

C’est un message clé que je répète, et qui me semble justifier un billet ici : il ne faut rien diffuser tant que la méthode n’est pas finie, les résultats et la discussion pré-écrits… Parce qu’en y réfléchissant méthodiquement, vous aurez des idées de ce que vous voulez (tel tableau, telle figure, limiter le biais de sélection, d’information…). C’est un peu moins vrai en qualitatif, mais tout de même, je vous incite à écrire un premier jet comme il vous vient, avant de l’affiner au fur et à mesure des réécritures.

Préparer le tableau

L’erreur communément faite est de partir du recueil de données et d’analyser chaque colonne sans savoir ce qu’on cherche… On peut y passer / perdre des heures.

La première étape consiste déjà à préparer le « Tableau 1 ». Le Tableau 1 est le tableau des caractéristiques, celui où on va donner plein d’informations sur la population étudiée (sexe, âge moyen ou médian…)

Plusieurs questions se posent et méritent réflexion avant même de commencer les statistiques :

• faut-il mélanger les données quantitatives et qualitatives ? Sauf si vous avez de la matière pour faire 2 tableaux séparés, ça peut être le cas ;
• faut-il utiliser des moyennes ou des médianes ? la médiane est plus pertinente pour les variables qui ne sont pas distribuées de façon normale, pour lesquelles les extrêmes vont avoir un poids très fort (par exemple « délai entre la naissance et la première prise de l’antibiotique X » : si sur 50 personnes, 40 ont pris l’antibiotique à 5 ans, et 10 en ont pris entre 50 ans, la moyenne sera de 14 ans mais la médiane restera à 5 ans, ce qui est plus logique…)
• quelle dispersion mettre ? si vous utilisez la moyenne, il faut prendre l’écart-type ; si vous utilisez la médiane, il faut prendre les 1^er et 3^ème quartile.

Voici un exemple de tableau 1 (le contenu n’a aucune importance, c’est la mise en forme qui compte) :

Tableau 1 : Caractéristiques de la population

Caractéristiques				Valeur*
Sexe	Féminin			40 [80 ± 6 %]
Age	(années)			71 (11,3)
Traitement	Consommation moyenne d’hypnotiques (en années)			16,9 (13,9)
	Consommation médiane d’hypnotiques (en années)			12 [10 – 20]
	Consommation quotidienne (nombre de patients)			39 [78 ± 6 %]
	Continueraient les hypnotiques déremboursés			45 [90 ± 4%]
	Ont déjà entendu parler de la TCC			6 [12 ± 5 %]
Etiologie de la première prise d’hypnotique	Familiale	Décès d’un proche		12 [24 ± 6 %]
		Événement familial		5 [10 ± 4 %]
		Expérience similaire du conjoint		1 [2 ± 2%]
	Santé	Problème de santé		12 [24 ± 6%]
		Addiction à l’alcool		1 [2 ± 2 %]
	Professionnelle	Stress au travail		6 [12 ± 5 %]
		Arrêt d’activité professionnelle		4 [8 ± 4 %]
		Horaire posté		2 [4 ± 3 %]
	Environnementale	Nuisances sonores		1 [2 ± 2%]
	Ne sait plus			6 [12 ± 5 %]
Sommeil sous hypnotique	Heure de prise de l’hypnotique (N = 48)**			21h39 (1h16)
	Heure de lever (N = 48)**			6h42 (1h17)
	Latence moyenne d’endormissement (en minutes)			53 (50,7)
	Nombre moyen de réveils nocturnes			1,32 (1,33)
	Durée de sommeil			8h03 (1h38)
Efficacité au long cours	Estiment les hypnotiques encore efficaces		Au bout de 6 semaines	44 [88 ± 5 %]
			Au bout de 6 mois	40 [80 ± 6 %]

*Les résultats quantitatifs sont exprimés en nombre de personnes sur un échantillon de 50 personnes [% ± écart-type] ; les résultats quantitatifs sont exprimés en moyenne (écart-type) sauf mention contraire (médiane [1^er quartile – 3ème quartile]

** Résultats sur 48 personnes (2 personnes avaient un coucher matinal dû à leur travail posté)

Ici, tous les traits sont apparents, parce que c’est un billet de blog… En pratique, les seuls traits apparents sont les 2 du haut et celui en bas.

Par contre, pour construire le tableau, il faut bien mettre chaque élément dans une case séparée, et ensuite « regrouper » (merge) les cases pour obtenir le design souhaité. Ne mettez jamais tout dans une seule case, en jouant avec des espaces ou des sauts de ligne, sous peine de grand désarroi de votre directeur de thèse. Par exemple, si vous faites ça, ça ne va pas :

Caractéristiques		Valeur	Intervalle de confiance à 95 %
Année d’installation (N = 92)	Avant 1981	3 (3,3 %)	[0 ; 6,9 %]
	De 1 981 à 1 987	13 (14,1 %)	[7,0 ; 21,2 %]
	De 1 988 à 1 994	23 (25,0 %)	[16,2 ; 33,8 %]
	De 1 995 à 2 001	14 (15,2 %)	[7,9 ; 22,6 %]
	De 2 002 à 2 008	7 (7,6 %)	[2,2 ; 13,0 %]
	2 009 et plus	32 (34,8 %)	[25,1 ; 44,5 %]
	SEXE : Homme  n =59                                           Femme   n=33 Total      92                                 100,0%   Age : <30ans n=2                                  30ans-50an  n=44                                             >50ans n=46   Total    n=92                             100,0%	64,1% 35,9%                                                          100,0%       2,2%                                                                            47,8%                                                                          50,0%                                                                100,0%	54,3% < f < 73,9%                                                                       26,1% < f < 45,7%         0,0% < f < 5,2% 37,6% < f < 58,0% 39,8% < f < 60,2%

Il y a des recommandations de mise en forme des tableaux également sur Equator Network. Je suis évidemment très léger ici, en mettant des ± par exemple, qui sont déconseillés dans les lignes directrices SAMPL citées hier. Le message principal c’est : chaque case doit contenir une seule information. Si vous faites ça, votre directeur et votre jury sera déjà sensible à la qualité de votre présentation.

Préparer les analyses descriptives

Il existe plusieurs logiciels possibles, déjà cités en section Méthodes.

En quantitatif, dans tous les cas (Excel, Jamovi, R, etc.), il y a plusieurs étapes :

1. saisie de données
2. vérification des données
3. analyses univariées (descriptives), qui permettent aussi de vérifier les données et de créer le Tableau 1
4. éventuellement, analyses bivariées
5. éventuellement, analyses multivariées

Par exemple, avec Excel, vous pourrez :

• filtrer les données du tableau ;
• créer de nouvelles variables (à partir de formules, notamment conditionnelles),
  • Par exemple les IMC, en supposant qu’en colonne A il y a le poids en kg, B la taille en m et C l’IMC : il suffit d’écrire dans la cellule C2 l’expression suivante : =A2/B2*B2. Ensuite, il suffit de cliquer sur le coin en bas à droite de la cellule pour la dupliquer, en incrémentant (augmentant) automatiquement les numéros de cellules et lignes (ça donnera donc C3=A3/B3*B3, etc.)
  • Le signe $ permet de figer la ligne et/ou colonne lors d’une incrémentation… Par exemple, si on veut calculer C3=A2/B3*B3, puis C4=A2/B4*B4, il faut pouvoir figer A2. Pour cela, il suffit d’écrire dès la première formule : $A$2 pour figer à la fois la colonne (A) et la ligne (2). Pour en savoir plus, il y a des informations simples ici ou sur des milliers de tutoriels en ligne sur Excel !
• créer des tableaux croisés dynamiques (Pivot Table, utile pour les tableaux de contingence…) :
  • Si besoin, vous pouvez vous renseigner sur la documentation Excel ou ici
• créer des graphiques (histogramme, boxplot…) (dans Insertion)
• faire des analyses statistiques des variables quantitatives (moyenne, médiane, écart-type, intervalles de confiance…)
• faire des analyses avec « Analysis Toolpack » :
  • à activer dans Options Excel > Compléments > Atteindre… > Analysis Toolpack
  • à utiliser dans Données > Utilitaire d’analyse > Statistiques descriptives
• et/ou faire des analyses plus poussées : je vous renvois ici à la page Objectif Thèse d’Emmanuel Chazard

Avant de préparer votre questionnaire, je vous invite à préparer les résultats que vous voulez recueillir avec 4-5 patients fictifs, pour anticiper les problèmes.

Quelques remarques dès ce stade :

• Il faut avoir des conventions différentes pour « rien » (0 par exemple) – « ne sait pas » – « donnée manquante » (classiquement #N/A ou une case vide).
• n’écrasez pas de données : si vous souhaitez recoder une variable, créez une nouvelle colonne pour ça.
• Quand on divise arbitrairement, il est plus classique de diviser en quartile, soit en 4 catégories.
• n’hésitez pas à présenter un premier extrait de votre tableau à votre directeur de thèse pour qu’il vous donne quelques indications ; il peut aussi être intéressant de commencer à faire des essais d’analyse sur les 10 premiers patients « pour s’amuser » (sans perdre trop de temps), afin de détecter les éventuels problèmes ;
• pour les analyses quantitatives (0, 1, 2…), vous pourrez utiliser Analysis Toolpack donc ; pour les analyses qualitatives (bleu, jaune, vert…), ce sont les tableaux croisés dynamiques qui vous seront le plus utile

Dans un premier temps, le plus raisonnable sera de faire des analyses purement descriptives (« univariées ») et d’en faire un tableau résumé bien présenté. C’est votre premier objectif et c’est de loin ce qui sera déjà le plus informatif dans votre travail : de qui parlons-nous, qu’ont-ils fait, etc. S’il y a une différence entre 2 groupes, ça se verra probablement dans ce tableau ! S’il y a besoin de tests statistiques très sophistiqués pour montrer un effet… c’est peut-être aussi qu’il n’est pas cliniquement très significatif.

C’est vraiment une démarche importante, parce qu’on a tous tendance à vouloir des résultats « statistiquement significatifs » et des petits p, mais ça n’est pas le plus important : le descriptif est bien plus informatif quand il est bien fait. 

Il faut notamment se rappeler que quand on multiplie les tests statistiques « à 5 % de chance de se tromper en affirmant qu’il existe une différence », au bout de 10 tests, on a 40 % d’avoir fait au moins une erreur (d’où l’intérêt de ne pas vouloir tout comparer). On dit parfois que le nombre de tests limite est égal à « nombre de patients inclus / 10 » (ça n’est pas une règle absolue).

Comment rédiger un questionnaire papier ?

Maintenant que vous avez une vision des résultats que vous voulez avec un Tableau 1 préparé, une idée des analyses que vous ferez… vous savez précisément ce que vous voulez recueillir !

Viens alors le temps du questionnaire (si c’est votre mode de recueil, comme souvent).

Vous pouvez commencer par un paragraphe type :

Les données collectées feront l’objet de traitement sous la responsabilité de M. Math Thèse. Conformément au Règlement Général sur la Protection des Données (UE) 2016/679 du 27 avril 2016 et à la loi Informatique et Libertés modifiée, vous disposez des droits suivants concernant vos données personnelles : accès, rectification, effacement, limitation, opposition, portabilité. Pour exercer ces droits, pour toute question ou pour en savoir plus sur la gestion de vos données, vous pouvez nous contacter à <adresse e-mail>.

Date de réponse (JJ/MM/AAAA)                                         |__|__|__|__|__|__|__|__|      [date]

[A droite, il y a l’intitulé repris dans la table de données présenté en-dessous. C’est facultatif, juste pour vous retrouver plus facilement. A noter qu’il ne faut ni espace (remplacer par un underscore « _ »), ni accent, ni nom à rallonge pour épargner les statisticiens…]

Quelle est votre date de naissance ? (JJ/MM/AAAA)          |__|__|__|__|__|__|__|__|      [naiss]

[Préférez les « vraies » données autant que possible si c’est justifié et sécurisé : date de naissance > âge > année de naissance > tranches d’âge. Vous pourrez vous-même reclasser après en 41-50 ans, 51-60 ans, 61-70 ans si ça vous chante… Mais il ne faut pas perdre de l’information au recueil !
Ici, on peut aussi se contenter de l’âge ou de l’année de naissance, s’il n’est pas justifié de recueillir le mois de naissance, le jour… Toute variable collectée doit être justifiée et proportionnée.]

Quel est votre sexe ?    [] Homme    [] Femme      [] Autre (précisez si vous le souhaitez : _________)  [sexe]  

Quelle est votre situation ? [] Chômage [] Retraité [] Actif

Quelle est votre profession ?      __________________                       [prof]

[Notez que vous pouvez utiliser les classes de l’Insee sur la situation socioprofessionnelle ; en demandant en ouvert (qualitatif), vous reclasserez ensuite vous-même… Là encore, le recueil doit pouvoir être justifié et proportionné]

Combien de cigarettes fumez-vous par jour actuellement ?       ______________   [cig]

[Même remarque que l’âge : c’est plus précis comme ça, plutôt que limiter à « 0-5 / 6-10 / 11-15 / 16-20 / 21+ » comme on voit parfois]

Aimeriez-vous arrêter de fumer ?                                                                                      [arret]

Pas du tout d’accord                                                                            Complètement d’accord 
1                       2                     3                      4         

[Il s’agit d’une échelle de Likert à 4 propositions, soit un nombre pair – incitant les répondants à se positionner plutôt d’un côté ou l’autre. Vous pouvez aussi faire 5 propositions pour un choix neutre possible]

Merci de votre participation. Souhaitez-vous recevoir les résultats de l’étude ?  [result]
[]   Oui [] Non

Une fois le questionnaire prêt, pour que ça soit clair, vous pouvez créer la « Table des variables et modalité » :

nom_var	Type	modalité	Signification
id	Id
date	date
naiss	date
sexe	binaire	1	Homme
		2	Femme
situ_prof	factor	1	Chômage
		2	Retraité
		3	Actif
prof	character
cig	numerical
Arret	factor	1	Pas du tout d’accord
		2	Pas d’accord
		3	D’accord
		4	Complètement d’accord
result	binaire	0	Non
		1	Oui

Il y a plusieurs types de variables :

• quantitatives (integer si nombre entier, numerical s’il y a des décimales),
• qualitative (factor, binaire ou – et en toutes lettres – character). En pratique, le character est factorisé ensuite en quelques catégories, pour l’analyse.

Dans un autre onglet, vous pouvez intégrer une table de données « test » en répondant avec de vraies personnes ou non

id	date	Naiss	sexe	situ_prof	prof	cig	arret	result
1	24/02/2016	12/12/1986	1	3	Médecin généraliste	0	NA	1
2	25/02/2016	22/03/1987	2	3	Eleveuse de licornes freelance	0	NA	0
3	26/02/2016	03/08/1992	1	.	Facteur	10	2	.

A noter que « NA » ou « . » veulent dire donnée manquante.
Attention à ne pas « imputer » n’importe comment : par exemple, « situ_prof » de l’id 3 est sûrement actif (3) vu qu’il a répondu « facteur » dans la profession… Toutefois, le questionnaire ne précise pas si c’est la situation actuelle… le patient pourrait être au chômage (1) et avoir noté « facteur » pour sa précédente profession ! Vous ne pouvez donc rien modifier vous-même pour ça. Par contre, « arret » = NA si « cig = 0 », c’est normal ; la variable « arret » ne s’exploite que dans le sous-groupe où « cig > 0 » (on ne peut pas vouloir arrêter de fumer si on ne fume pas).

Attention aux données que vous choisissez : par exemple, « rural », « urbain », « semi-urbain » ça pose toujours des questions de définition (il y a des travaux sur ce sujet de l’interprétation de ces données)

Quand faut-il préparer la table des données ?

Contrairement à ce qu’on peut penser instinctivement, il faut mieux préparer la table des données avant la diffusion du questionnaire (et pas au moment de l’informatisation des données papiers). 

Essayez de remplir vous-même un questionnaire (en papier ou informatique) et de le transcrire sur votre tableur pour dépister les problèmes. Ce « bêta-test » est indispensable, idéalement avec quelques amis (4-5 suffisent).

Après la diffusion, remplissez votre tableau avec les premières fiches, également pour éviter de découvrir un problème trop tardivement.

Envoyer le questionnaire en papier ou par mail ?

Les questionnaires en ligne (type LimeSurvey…) ont plusieurs avantages :

• enregistrement automatisé de la date et d’un identifiant,
• différenciation des questions à réponse unique et à réponses multiples,
• possibilité de faire des questions à réponses obligatoires (diminution des données manquantes),
• recueil directement des données dans un tableur (gain de temps, pas d’erreur de recopiage du papier au tableur),
• quelques analyses descriptives réalisées directement,
• gratuité (pas de frais postaux contrairement au questionnaire papier),

… mais aussi quelques inconvénients :

• biais de sélection (si vous interrogez des médecins généralistes, vous vous limitez à ceux qui sont informatisés, ont une adresse mail) :
  • il faut surtout voir s’il s’agit d’un biais différentiel ou non — pour faire simple, si votre sujet concerne la technique de vaccination d’un médecin, il n’y a pas de raison que ça diffère en fonction de son adresse mail (non différentiel) ; par contre, si vous vous intéressez au taux de feuilles de soins papier, le fait d’exclure par votre recrutement les médecins non informatisés risque d’induire un biais différentiel.
• risque de perte de contrôle : à combien de personnes le questionnaire a été envoyé ?

En résumé :

• l’envoi postal :
  • le + : ça incite les gens à répondre un peu plus ; ça permet de connaître le taux de réponses avec certitude (sur le nombre d’envoi)
  • le – : c’est plus cher puisqu’il faut le timbre d’envoi et le timbre de retour, avec le risque que les gens n’y répondent pas en plus…)
• l’envoi par mail :
  • le + : c’est gratuit, du coup on peut sélectionner plus de gens (mais il faut les appeler avant pour avoir une adresse mail) ; par ailleurs, le tableur est fait automatiquement.
  • le – : ça incite moins à y répondre… et ça n’est pas toujours si simple de récupérer des adresses mails (plus simple d’avoir des adresses postales).

A mon sens, la version mail est la plus « rentable » :

• le temps de mettre sur un questionnaire en ligne n’est pas très long ; faites bien attention à mettre des questions à réponses multiples là où il faut, etc.
• le temps d’imprimer, recopier l’adresse sur l’enveloppe et votre adresse sur l’enveloppe de retour = le temps passé à appeler / récupérer l’adresse mail
• le temps passé à transférer les fiches papier sur un tableur = n’existe pas si fait directement sur un formulaire informatique !
• les heures gagnées à ne pas transférer ces fiches peuvent être employées à appeler d’autres personnes… (contrairement au format papier où vous serez limités, ne serait-ce que financièrement, à près de 2€/envoi…)
• enfin, par informatique, vous éliminez directement les non-intéressés, les médecins retraités/en vacances, et vous gagnez les temps postaux d’envoi/réception.

Dans tous les cas, il faut comprendre le principe d’un questionnaire au format papier afin de réaliser un questionnaire informatique pertinent.

A Lille, vous pouvez diffuser via LimeSurvey en allant sur cette page. Les règles de bonnes pratiques sont disponibles ici : https://enquetes-etablissement.univ-lille.fr/ (et pour l’anonymat, il y a cette page).

A qui envoyer ?

Evidemment, cela dépend de votre public cible !

Mais dans ce public cible, l’idéal est d’avoir un échantillon aléatoire. Si le caractère local ou régional n’a pas d’intérêt, il est préférable d’opter pour un échantillon national qui sera plus facile à publier ou diffuser.

Vous pouvez utiliser le répertoire RPPS par exemple, ou la liste officielle des codes postaux si c’est pertinent. Pour faire une requête aléatoire sur Excel, vous pouvez utiliser : =RANDBETWEEN(0 ;100 000) ou =ALEA.ENTRE.BORNES(0 ;100000). Une fois la colonne triée, pensez à faire copier puis « coller des valeurs » (option de « collage spécial »), pour éviter une actualisation à chaque ouverture du fichier !

Si vous appelez pour récupérer des adresses, il faut bien noter :

• le nombre de médecins appelés,
• le nombre de médecins donnant l’adresse mail,
• le nombre de médecins répondant.

En moyenne, vous pouvez compter 500 coups de fils pour récupérer 100 adresses mails et 50 réponses… c’est évidemment variable selon votre présentation, votre talent de commercial, l’intérêt de votre sujet, etc.

Si vous diffusez par la faculté à tous les internes, je vous conseille de respecter ces 4 consignes :

• Faire un mail court (les internes et MSU en reçoivent beaucoup, il faut un mail lisible)
• Annoncer le nombre de questions (faible idéalement !) et pas de minutes (… à cause des précédents qui ont dit 5 minutes alors qu’on y a passé 20 minutes !)
• Annoncer une récompense : une fiche de synthèse inédite, etc.
• … et avoir un sujet qui peut intéresser le public interrogé !

(Bon, il est 21h57, je vais essayer de faire court…)

La section « matériels et méthodes » est le mode d’emploi ou la recette pour votre travail : grâce à elle, le lecteur saura ce que vous avez fait et pourra reproduire le travail à l’identique (répliquer) dans la même population ou dans une autre.

Il faut être précis sur les différents éléments :

• type d’étude (study design / protocole expérimental)
• lieu, date de l’étude
• population cible – population incluse / population exclue
• méthodologie de recrutement
• variables étudiées / mesures et recodage de variables
• nombre de sujets nécessaires (ou saturation des données en qualitatif)
• aspects réglementaires et éthiques
• méthodes d’analyses utilisées
• logiciel utilisé

Vous devez répondre aux questions « qui » a fait « quoi », « quand », « où », « comment », « pourquoi » (Who / What / When / Where / How / Why).

Il faut donc être complet… C’est typiquement une section que vous pouvez écrire volontiers à la fois passive (et au passé) car « le quoi importe plus que le qui »… même s’il n’est pas interdit de jongler avec de la voix active pour varier (avec le risque toutefois de commencer chaque phrase par « nous avons… »).
Dans cette section, vous pouvez être un peu plus ennuyeux qu’en introduction / discussion ; néanmoins, vous pouvez réutiliser la technique évoquée plus haut de « relire les verbes » pour trouver des verbes forts et rendre l’écriture un peu plus dynamique.

Dans cette section, plus que les autres, vous allez aussi utiliser du jargon statistique. Néanmoins, tout ça n’empêche pas de rendre la vie facile au lecteur : vous pouvez faire des coupures avec de petites sections titrées (sujets, protocole expérimental…), citer une référence comme méthode usuelle plutôt que tout détailler (comme décrit précédemment et référence), puis proposer un diagramme de flux dans les résultats pour présenter les inclus / exclus, etc. Le but n’est pas d’être incompréhensible !

La thèse n’a pas forcément à être écrite de façon linéaire : à mon sens, l’écriture itérative est plus rapide et efficace pour ce type de travail.
La (pré-)rédaction des résultats permettra d’améliorer la méthode, les variables à rechercher pour obtenir des résultats dans la forme voulue (… pour le fond des résultats, ça, ça sera à découvrir ensuite !). La pré-rédaction de la discussion permettra aussi d’améliorer la méthode : elle servira à identifier les biais à venir, et donc les moyens de les prévenir dans la discussion.

Enfin, une autre façon d’améliorer votre thèse est d’utiliser une grille d’évaluation (ou ligne directrice) pour votre propre travail. Le site Equator Network en comporte plus de 600, dont les principales ont fait l’objet d’une traduction en français par Michel Gedda, rédacteur-en-chef de Kinésithérapie, la revue :

• Recherche qualitative (entretien individuel et focus group) : COREQ (disponible en français) ou SRQR
• Synthèse de recherche qualitative : ENTREQ (disponible en français)
• Etude observationnelle (transversale, cas-témoin, cohorte) : STROBE (disponible en français)
• Etude diagnostique ou pronostique : STARD (disponible en français)
• Revue systématique (et méta analyse) : PRISMA (disponible en français)
• Essai contrôlé randomisé : CONSORT (disponible en français)
• Case report : CARE (disponible en français)
• Médico-économique : CHEERS
• Qualité et sécurité des soins : SQUIRE (disponible en français)

De façon plus spécifique, vous avez également des recommandations pour l’écriture :

• De protocole standard pour essai clinique, études expérimentales et protocoles diverses : SPIRIT (disponible en français)
• De l’analyse statistique : SAMPL (disponible en français)